Поскольку доходы и расходы бюджета формируются по средствам различных факторов, нередким явлением экономики государства является дефицит бюджета, в особенности это ярко выражено в условиях нестабильной макроэкономической ситуации и геополитического напряжения. Дефицит консолидированного бюджета субъектов РФ будет покрываться в основном за счет выдачи заемных средств кредитными организациями, федеральным бюджетом, средствами полученными с продажи акций и иных государственных и муниципальных ценных бумаг.
Для снижения рисков дефицита средств региональных бюджетов и бюджетов на местных уровнях, связанных с малой сбалансированностью бюджетной обеспеченностью на текущий год, предусмотрена индексация равная уровню инфляции по конкретному виду финансовой поддержки. Помимо этого государством планируется повысить общий объем дотаций выделенных для субъектов РФ, из-за присоединения к России Крыма и Севастополя. В последующих периодах объем дотаций возрастет с учетом средств на формирование резервного фонда на 15% в 2016 году и на 20% в 2017 году.
Правительственный аппарат учитывает риски связанные с изменением внешних и внутренних макроэкономических факторов, так, например, в случае долговременного падения цен на нефть государственные органы управления планируют дополнительные меры стабилизации бюджета РФ. По словам Антона Силуанова, в случае возникновения данного риска, в основном внимание будет заострено на пересмотрении расходной части бюджета, но помимо этого есть альтернативные варианты, такие как повышение налогов или наращивание дефицита.
Таким образом, для стабилизации экономической ситуации правительство в основном использует изменения налогового режима, снижение государственных расходов, оптимизацию трансферов, снижение процентов по государственным займам.